ノボジーン | SSMS～微生物ソリューションに新しいツール

シャローショットガンメタゲノムシーケンスを使用することで、より高度な分類解像度でバイアスの少ない微生物叢の解析が可能となり、また研究コストも抑えることができます。

シャローショットガンメタゲノムシーケンスは自分の研究に適しているか？

ノボジーンの微生物ソリューションの新しいツールであるシャローショットガンメタゲノムシーケンス (SSMS) をご紹介します。SSMは、2GB以下のデータで、16Sシーケンスとディープメタゲノムシーケンスのギャップを埋める費用対効果の高い方法を提供します。ディープショットガンメタゲノミクスが高解像度マイクロバイオーム解析のゴールドスタンダードであり続ける一方で、SSMSはアンプリコンシーケンスの強力な代替手段であり、増幅によるPCRバイアスがほとんどない種レベルの分類群を提供し、増幅領域に制限されないので異なる分類群にわたる分類学カバレッジを提供することができます。今日のマイクロバイオーム研究における増幅の課題に対処し、比較分析も提供します。

SSMSの優位性

ショットガンメタゲノムよりも安価で、株レベルの特徴づけを行わない大規模腸内細菌叢研究に適しています。
ディープショットガンメタゲノムシーケンスと同様の分類群の情報を提供することができます。
微生物叢の解析に偏りがより少なくなっています。
アンプリコンシーケンスよりも高い分類解像度が得られます。

シャローショットガンメタゲノムシーケンスとその他のメタゲノム解析ソリューションについては、フライヤーをダウンロードしてご覧ください。

ノボジーンとパートナーである特長とメリット

異なるシーケンシングプラットフォームにわたって複数の製品を同時に扱うワンストップソリューション。
DNA抽出からデータ解析、納品までのエンドツーエンドサービスを、より短い納期でご提供します。
カスタマー・サービス・システム（CSS）により、サンプルQCからデータ納品までリアルタイムに実験を追跡し、競争力のある納期を実現します。
当社の優秀なテクニカルスペシャリストと営業担当者は、お客様のプロジェクトをより良くサポートするために配置*されています。

*直販国以外の場合は、当社のグローバルパートナーネットワークと連携しています。

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最近のマイクロビオーム研究

ショットガン・メタゲノミクス・シーケンスを用いて腸内細菌叢の組成変化と微生物間の相互作用を解明

香港中文大学のJun Yu教授とその研究チームは、タバコを吸うと腸内細菌叢の異常が誘発され、腸管バリア機能障害を刺激することで腫瘍形成が促進されることを明らかにしました。この腸管バリア機能障害は、発がん性および炎症性シグナル伝達経路を活性化することにより、最終的に大腸腫瘍の発生に寄与することが明らかになりました。ノボジーン社から提供されたショットガン・メタゲノミクス・シーケンスを用いて、腸内細菌叢組成の変化と微生物の相互作用を発見しました。

(Yu. J, Wei H & et al)

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